Trên đoạn biên giới do Đồn Biên phòng Lũng Cú, BĐBP Hà Giang quản lý có nhiều đường mòn, lối mở, địa hình hiểm trở, khí hậu khắc nghiệt tiềm ẩn nguy cơ diễn ra hoạt động xuất, nhập cảnh trái phép. Trong thời gian qua, đơn vị đã triển khai đồng bộ các biện pháp nghiệp vụ bảo vệ vững chắc chủ quyền lãnh thổ, an ninh biên giới quốc gia và phòng, chống dịch Covid-19.