Bước đầu, nguyên nhân vụ tai nạn được xác định là do Phan Thành Được điều khiển tàu du lịch không giảm tốc độ, không giữ khoảng cách an toàn khi đến khu vực bến thủy nội địa dẫn đến va chạm với phà AG-21477 gây tai nạn.